美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會和分子病理學(xué)協(xié)會（ACMG/AMP）關(guān)于解釋序列變異的建議指出，根據(jù)多個計算機預(yù)測工具結(jié)果使用支持性證據(jù)，即支持致病（PP3）或支持良性（BP4）。然而，由工具開發(fā)人員定義的評分閾值及需要多個預(yù)測結(jié)果一致的ACMG/AMP建議均缺乏定量支持。之前，ACMG/AMP建議量化證據(jù)等級（支持、中等、強、非常強）。ClinGen的專家們將這個框架擴展到軟件預(yù)測，并引入了一個新的標準，即將軟件預(yù)測的分數(shù)轉(zhuǎn)換為PP3和BP4的證據(jù)強度。該方法基于估計局部陽性預(yù)測值，并可以校準每種變量類型的計算工具或其他連續(xù)規(guī)模性證據(jù)。專家們使用挑選過的數(shù)據(jù)集評估了13種錯義突變預(yù)測工具的致病性和良性證據(jù)強度對應(yīng)的閾值。根據(jù)新閾值結(jié)果，發(fā)現(xiàn)大多數(shù)工具達到了致病性和良性分類的支持水平，多個工具達到了中等水平，有幾個工具達到了強水平，有一個工具達到了非常強水平。基于這些發(fā)現(xiàn)，專家們提出了根據(jù)單個預(yù)測工具結(jié)果對ACMG/AMP標準的PP3和BP4進行循證修訂的建議，以及對臨床解釋計算方法的未來評估。
